为探索农业科技体制改革和农业科研治理机制，提高我国农业废弃物处理与资源化利用创新能力和共享利用的效率，支撑农业绿色发展，在农业农村部科技教育司的指导下，于2016年12月11日由研究所牵头，联合全国农业废弃物处理利用优势科研院所、高校、技术推广单位、企业等102家单位，共同成立了农业废弃物循环利用创新联盟。该联盟面向农作物秸秆、养殖废弃物、农膜等投入品废弃物无害化处理与资源化利用的重大需求，致力于搭建布局合理的“一盘棋”工作格局，打造一批农业废弃物循环利用基地样板，构建产业全链条的“一条龙”组织模式，形成“一体化”综合解决方案，解决畜禽粪污资源利用率低、污染风险高、种养结合不畅，秸秆清洁供暖中效率低、污染物排放高，以及地膜难降解、回收利用难等问题，推动农业废弃物循环利用，助力农业绿色发展，服务国家“三农”事业。

       近年来，农业废弃物联盟支撑第二次全国污染源普查，牵头组织开展畜禽、秸秆、地膜原位监测，测算农业废弃物产排污系数和产排污量；开展农业废弃物处理与资源化利用事业发展重大问题调研，提出发展咨询报告；承担国家及农业部重大科技任务，协同开展农业废弃物资源化利用科技创新与长期基础性科技工作，制定《畜禽粪污土地承载力测算技术指南》等技术规范，由农业农村部发布，在585个养殖大县应用；实施“京津冀畜禽废弃物利用科技联合创新行动”，总结提炼3种不同规模/主体的7种技术模式并示范，为全国畜禽养殖废弃物资源化利用提供可复制可推广的模式；创新研发秸秆炭气联产清洁供暖技术成套装备，提出分散型村落单户供暖、中心村集中供暖、城郊型村镇社区集中供气等三种模式，在北方12个省市推广应用；研发出KF16-1等新型生物降解地膜、农田机械化地膜回收技术与装备等，显著提高了农膜回收率达85%以上，在新疆生产建设兵团示范应用。